Mata kuliah Kapita Selekta Pendidikan Islam menuntun dan mengarahkan mahasiswa agar berfikir analitis dan kritis terutama dengan menerapkan kaidah deduktif dan induktif, agar mahasiswa berwawasan luas dalam menanggapi permasalahan pendidikan di Indonesia. Mata Kuliah Kapita Selekta Pendidikan Islam mencakup pembahasan tentang persoalan-persoalan kontemporer kependidikan Islam di Indonesia, tema-tema yang dibahas menyangkut konsep dan penyelenggaraan pendidikan serta pembaharuannya, terutama berkenaan dengan system pendidikan Islam, system pendidikan nasional, lembaga pendidikan Islam, penyelenggaraan pendidikan agama Islam, kebijakan politik penyelenggaraan pendidikan, komposisi pendidikan Islam dalam arena pendidikan modern, dan perbandingan pendidikan dengan sebagian negara lain di dunia.